En uno de los montículos cercanos al lugar se han encontrado piedras de molinos Vettones que nos hablan de sus primitivos pobladores.
Fontanares plural del colectivo fontanar «lugar de fuentes». En documentos del siglo XV se alude ya a los veneros que son el portezuelo de Fontanares, donde se departen los caminos reales para ir a Toledo y Talavera. Es una realidad que Hontanares posee en su término un buen número de fuentes y manantiales, muchos de ellos actualmente secos.
Ha permanecido unido al municipio de Arenas, pese a la distancia, como consecuencia de que varias de sus dehesas las donó doña Juana de Pimentel al pueblo de Arenas como gratificación por sostenerla con hombres armados en los duros momentos en que tuvo que luchar para conservar sus estados frente al Rey, tras la muerte de su esposo don Álvaro de Luna.